Além da estrutura diretamente voltada à pós-graduação, o Programa tem acesso à estrutura de serviços e apoio técnico do Instituto de Ortopedia e Traumatologia do HCFMUSP.
Destacamos os seguintes serviços administrativos e de apoio técnico complementares aos descritos:
- Centro Administrativo do IOT-HCFMUSP (Diretoria Executiva, Assessoria Técnica da Diretoria Executiva, Diretoria da Divisão de Enfermagem, Diretoria da Divisão de Medicina Física, Secretaria do Conselho Diretor, Secretaria do Corpo Clínico, Secretaria do Serviço de Fisioterapia, Secretaria do Serviço Social Médico, Centro de Comunicação Institucional, Serviço de Administração, Secretaria de Recursos Humanos, Centro de Controle de Infecção Hospitalar – CCIH, Hospital Sentinela ANVISA-MS, Centro de Educação Permanente e salas de reunião);
- Unidade de Planejamento e Gestão (Centro de Gerenciamento da Fundação Faculdade de Medicina);
- Secretaria da Fundação Ortopedia – FO e do Centro de Estudos Godoy-Moreira – CEGOM;
- Centro de Informática (desenvolvimento de programas, suporte e sistemas da rede IOT NET);
- Registro Geral de Pacientes;
- Centro de Documentação Científica (arquivos médicos);
- Reprografia;
- Área de Convivência da Residência Médica
- Serviço de Nutrição e Dietética (Cozinha e Refeitórios) associado à Cozinha Experimental;
- Serviço de Conservação e Reparos;
- Serviço de Suprimentos;
- Central de Mensageiros;
Destaca-se também a existência de estrutura acadêmica, de salas de reunião e de aula que estão à disposição dos orientadores e alunos:
- Departamento de Ortopedia e Traumatologia da FMUSP (Secretaria dos Professores Titulares, Secretaria de Graduação e Pós-Graduação sensos lato e estrito);
- Diretoria Científica e Secretaria da Comissão Científica do IOT-HCFMUSP e DOT-FMUSP;
- Serviço de Biblioteca Documentação Científica e Didática – SBDCD
- Sala da Tele ortopedia (ensino a distância, vídeo e teleconferências);
- Sala da Disciplina de Ortopedia Pediátrica e da Disciplina de Ortopedia Especializada;
- Sala dos Grupos de Especialidade (cinco salas distintas)
- Sala da Disciplina de Ortopedia Geral e da Disciplina de Traumatologia, Mão e Microcirurgia;
- Anfiteatros;
- Auditórios e salas de aula (5);
- Áreas de Eventos (2).