Actúa en la enseñanza y entrenamiento de médicos en el área de microcirugía reconstructiva, además de la realización de investigaciones en cirugías reconstructivas de nervios periféricos y médula, con significativa contribución para el avance científico del área. Dispone de monitoreo constante y programación de entrenamiento extensivo (4 meses) e intensivo de una semana, de acuerdo con la disponibilidad del interesado. El Centro de Atención de Emergencia en Microcirugía Reconstructiva y Cirugía de la Mano atiende a los pacientes víctimas de traumas que resulten en fracturas expuestas del tipo III-B y III-C de Gustillo y Anderson, amputaciones traumáticas de miembros, lesiones de nervios periféricos y traumas complejos de la mano, reimplantes de extremidades amputadas, colgajos microquirúrgicos de urgencia, reconstrucción de nervios periféricos de urgencia, tratamiento de lesiones complejas de la mano (osteosíntesis, reparación de las lesiones de tendones, cirugías reconstructivas). En 2018 recibió financiamiento de la Fundación Itaú Social para readecuación de la sala de microcirugía perteneciente al Laboratorio de Microcirugía del IOT/HC/FMUSP (ver ítem específico de captación de recursos).
La estructura permite la realización de entrenamiento de varios postgraduandos simultáneamente, así como la realización de proyectos de investigación complejos en microcirugía. La estructura cuenta con cinco microscopios quirúrgicos DF Vasconcelos MC-A184, tres bancadas, dos microcoaguladores Emai BO-50, dos cajas de micro instrumentales quirúrgicos ASSI, cinco cajas de micro instrumentales quirúrgicos AESCULAP, autoclave Stermax, estufa para secado de materiales Odontobrás EL, Sistemas de televisión y grabación de imágenes.
En 2018 recibió de la Fundación Itaú Social la cantidad de R$200.000,00 para la readecuación de la sala de microcirugía perteneciente al Laboratorio de Microcirugía del IOT/HC/FMUSP.
El Laboratorio Rotary de Microcirugía del Instituto de Ortopedia y Traumatología (IOT), fundado en 1997, fue reinaugurado el día 11 de octubre de 2019. Está más amplio y equipado con doce microscopios de última generación para entrenamientos que van desde sutura en guantes hasta la técnica de microanastomosis en vasos sanguíneos de pequeño calibre. El laboratorio reinicia las actividades después de cuatro meses de reforma. La repaginada estructural, para mejor acomodación y realización de los cursos, fue posible a través de un acuerdo de cooperación del IOT, Rotary Club y Banco Itaú. «La excelencia del Laboratorio de Microcirugía es una prueba de la importancia del acuerdo de cooperación con la iniciativa privada, uniendo la experiencia universitaria con los recursos de la iniciativa privada.”